Ao longo da execução dos cursos foi possível a organização de um setor de arquivos onde se encontram guardados documentos sobre a Educação Escolar Indígena como trabalhos, textos, cartazes, pesquisas, fotos e monografias de diversos projetos desenvolvidos no Estado de Mato Grosso, como o Projeto Tucum.
A documentação pedagógica e administrativa produzida encontra-se catalogada e arquivada na Secretaria Acadêmica, no acervo denominado Acervo Joana Saira, constituindo-se num amplo banco de dados, com mais 57.000 documentos catalogados sobre a educação escolar indígena intercultural.
Integram também esse acervo dados sobre a situação linguística, as aldeias, as escolas e dados pessoais dos estudantes.O acervo bibliográfico vem sendo constantemente ampliado com aquisição de novos títulos, dispondo à comunidade acadêmica mais de 3.700 títulos, em sua maioria relacionados à questão indígena.
Os cursos ainda dispõem de um acervo fotográfico com 7.000 fotografias catalogadas, um acervo etnográfico com aproximadamente 500 peças e um acervo de mídia (fitas, CDs e DVDs) com cerca de 150 exemplares.
O processo de catalogação do acervo é auxiliado por um sistema informatizado de banco de dados.
Material sobre a educação escolar indígena
3.686 publicações disponíveis na biblioteca
5.671 fotos registradas
57.000 documentos catalogados
485 peças etnográficas cadastradas
Além de dados pessoais, educacionais e sócio-linguísticos sobre os professores indígenas